Hvad er forskellen mellem 16s rRNA og 18s RRNA?
Hvad er forskellen mellem 16s rRNA og 18s RRNA?

Video: Hvad er forskellen mellem 16s rRNA og 18s RRNA?

Video: Hvad er forskellen mellem 16s rRNA og 18s RRNA?
Video: RNA struktur, typer og funktioner 2024, November
Anonim

Det vigtigste forskel mellem udføre analyser med 18S rRNA gendata i stedet for 16S rRNA gendata (eller ITS-data) er referencedatabasen, der bruges til OTU-plukning, de taksonomiske tildelinger og den skabelonbaserede justeringsopbygning, da den skal indeholde eukaryote sekvenser.

I betragtning af dette, hvorfor bruges 16s rRNA-genet til identifikation?

Det 16S ribosomalt RNA-gen koder for RNA-komponenten i 30S-underenheden af det bakterielle ribosom. På grund af kompleksiteten af DNA-DNA hybridisering, 16S rRNA-gen sekventering er Brugt som et værktøj til identificere bakterier på artsniveau og hjælper med at differentiere mellem nært beslægtede bakteriearter [8].

Derudover har eukaryoter 16s rRNA? Det 16S rRNA gen er til stede i alle bakterier, og en beslægtet form forekommer i alle celler, inklusive dem af eukaryoter.

Spørgsmålet er også, hvad er 18s og 28s rRNA?

Det 28S / 18S ribosomalt RNA ratio bruges ofte til at vurdere kvaliteten af totalt RNA oprenset fra en given prøve. Hos mennesker, 28S rRNA har ~5070 nukleotider, og 18S har 1869 nukleotider, hvilket giver en 28S / 18S forhold på ~2,7. En høj 28S / 18S forholdet er en indikation af, at det oprensede RNA er intakt og ikke er nedbrudt.

Hvad er 16s rRNA-sekventering?

16S rRNA gen rækkefølge analyse er en standardmetode inden for bakteriel taksonomi og identifikation, og er baseret på påvisning af rækkefølge forskelle (polymorfismer) i de hypervariable områder af 16S rRNA gen som findes i alle bakterier.

Anbefalede: